Slovenya ve Türkiye arasındaki diplomatik ilişkiler dönemin iki ülke Dışişleri Bakanları tarafından 26 Ağustos 1992 tarihinde imzalanan protokol ile tesis edilmiştir. Büyükelçiliğimiz 1 Nisan 1993 tarihinde faaliyete geçmiştir.

5 Mayıs 1993 tarihinde Büyükelçi Sayın İlhan Yiğitbaşıoğlu Cumhurbaşkanı Milan Kuçan'a güven mektubunu sunarak Türkiye'nin Slovenya'daki ilk Büyükelçisi olarak göreve başlamıştır.

1927 yılı yapımı 3 katlı müstakil bir bina olan Kançılaryamıza 1993 yılında taşınılmıştır. Kiralık olan Kançılarya binamız, resmi kurum ve kuruluş binalarına yakın konumdaki Bezigrad semtinde bulunmaktadır.